הרעיון שעומד מאחורי התפקיד של רשם העמותות הוא מאוד פשוט. על מנת למנוע מצב שעמותות יפעלו ללא פיקוח ובקרה, מצב שעלול להוביל לידי כך שאנשים יתרמו להן מבלי לדעת למי הם תורמים, אנשים יתנדבו מבלי לדעת למה ומה המטרה, וכמובן בשביל למנוע שעמותות מהוות ארגוני קש שכל מטרתם למשוך כספים או להלבין כספים, אז קיים גוף שקובע את הכללים ודואג לפקח על הרישום, פיקוח ובקרה שלהן. זאת מתוך הסמכויות שהוענקו לו על פי חוק.
למעשה, כל עמותה שמבקשת לפעול במרחב הציבורי, בין אם מדובר בעמותות ללא כוונת רווח או עם כוונת רווח, עמותות פוליטיות, אזרחיות, חברתיות, עמותות ספורט, תרבות ואחרות, כולן חייבות להירשם אצל רשם העמותה, הן חייבות לעמוד בכללים ובחוקים, ובמידה והן חורגות מכך, הרי שניתן להעניש את מי שעומד בראש, ובמקרים מסוימים אפילו אפשר לדרוש את פירוק העמותה, במידה ומתברר שהיא איננה מקיימת את ייעודה ועוברת על החוק.
